Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RBBP4Q09028 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms