Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
EPHB4P54760 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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