Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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