Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RTN1Q16799 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RTN1Q16799 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RTN1Q16799 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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