Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ME3Q16798 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ME3Q16798 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ME3Q16798 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ME3Q16798 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ME3Q16798 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ME3Q16798 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ME3Q16798 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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