Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NPTX1Q15818 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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