Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNHIT3Q15649 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms