Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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SHHQ15465 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SHHQ15465 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHHQ15465 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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