Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ATMQ13315 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATMQ13315 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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