Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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