Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SMARCB1Q12824 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SMARCB1Q12824 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SMARCB1Q12824 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SMARCB1Q12824 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SMARCB1Q12824 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMARCB1Q12824 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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