Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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BRPF3Q9ULD4 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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BRPF3Q9ULD4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BRPF3Q9ULD4 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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