Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
RBM42Q9BTD8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RBM42Q9BTD8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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