Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CITED1Q99966 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms