Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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RTL8BQ17RB0 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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RTL8BQ17RB0 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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