Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLPPQ16740 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CLPPQ16740 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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