Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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