Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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