Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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