Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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