Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms