Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms