Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms