Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms