Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk1bQ9Z2C6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms