Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf1Q9Z1B8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Phf1Q9Z1B8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf1Q9Z1B8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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