Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms