Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sumo3Q9Z172 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sumo3Q9Z172 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sumo3Q9Z172 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sumo3Q9Z172 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sumo3Q9Z172 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sumo3Q9Z172 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sumo3Q9Z172 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sumo3Q9Z172 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms