Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms