Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gipc1Q9Z0G0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc1Q9Z0G0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms