Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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