Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcn5Q9WVD4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcn5Q9WVD4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms