Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms