Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms