Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sorbs3Q9R1Z8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms