Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn7Q9R1S8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms