Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx6Q9R1R0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms