Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb3Q9R1P1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms