Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mpdu1Q9R0Q9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms