Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms