Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Col4a4Q9QZR9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Col4a4Q9QZR9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Col4a4Q9QZR9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a4Q9QZR9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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