Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcf1Q9QZM3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clcf1Q9QZM3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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