Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms