Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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ChmlQ9QZD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChmlQ9QZD5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms