Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubxn8Q9QZ49 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms