Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vnn3Q9QZ25 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms