Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms