Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ehd3Q9QXY6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ehd3Q9QXY6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms