Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnip3Q9QXT8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Kcnip3Q9QXT8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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