Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms